А что, файлы, полученные из формата X, конвертированные обратно в Max, уже будут отличаться от своих исходников?
Ну если отбросить мягко говоря сложности с "конвертированне обратно в MAx" (что само по себе нетривиальная задача), то конечно будут отличаться. Оно же после этого вообще редактированию с трудом поддается. Это как если бы делать сразу не объектами и полигонами, а из треугольников майстрячить модельку. Оно почти не поддается редактированию, я уже не говорю про создание лод уровней.
